Μοριακός έλεγχος γενετικών δεικτών
-
Ανίχνευση μετάλλαξης της απολιποπρωτείνης Β
ApoBΑνίχνευση μετάλλαξης της απολιποπρωτείνης Β - ApoB
Γενικά
Οι γενετικές υπερλιποπρωτεϊναιμίες έχουν κλινική σημασία λόγω του ρόλου που παίζουν στο έμφραγμα του μυοκαρδίου, μιας από τις μείζονες αιτίες θανάτου. Οι υπερλιποπρωτεϊναιμίες χαρακτηρίζονται από υψηλά επίπεδα λιπιδίων στο πλάσμα και ειδικών λιποπρωτεϊνών. Η απολιποπρωτείνη Β παράγεται στο ήπαρ και συμμετέχει στο μεταβολισμό των λιπιδίων. Το μεταλλαγμένο αλληλόμορφο του γονιδίου της απολιποπρωτείνης Β προκύπτει από μια μετάλλαξη στη θέση 3500 του φυσιολογικού γονιδίου και κληρονομείται ως αυτοσωμικός επικρατής χαρακτήρας. Τόσο οι ομοζυγώτες όσο και οι ετεροζυγώτες ανήκουν στις ομάδες υψηλού κινδύνου για να εκδηλώσουν πρόωρη καρδιακή νόσο, ως αποτέλεσμα των αθηρωμάτων, ξανθωμάτων και τοξοειδή κερατοπάθεια (εναπόθεση χοληστερόλης στην περιφέρεια του κερατοειδούς χιτώνα). Η ετερόζυγη μορφή, με πληθυσμιακή συχνότητα τουλάχιστον 1 στα 500 άτομα, είναι μια από τις συνηθέστερες ανθρώπινες μονογονιδιακές διαταραχές.Βιολογικό υλικό
Περιφερικό αίμα σε στείρο σωληνάριο γενικής με αντιπηκτικό EDTA.Εργαστηριακή διερεύνηση
Ενίσχυση του γονιδίου της απολιποπρωτείνης Β με PCR και επιβεβαίωση της ύπαρξης ή μη του μεταλλαγμένου αλληλομόρφου με πέψεις με περιοριστικές ενδονουκλεάσες (RFLPs).Αποτελέσματα
Τα αποτελέσματα είναι έτοιμα σε 5 εργάσιμες ημέρες. -
Ανίχνευση μετάλλαξης της απολιποπρωτείνης E
ApoEΑνίχνευση μετάλλαξης της απολιποπρωτείνης E - ApoE
Γενικά
Το γονίδιο της apo E έχει 3 αλληλόμορφα (e2, e3, e4) που κωδικοποιούν για 3 ισομορφές της απολιποπρωτείνης Ε (Ε2, Ε3, Ε4). Τα αλληλόμορφα κληρονομούνται με συνεπικρατή τρόπο με αποτέλεσμα να υπάρχουν 6 διαφορετικοί γονότυποι (e2/e2, e2/e3, e2/e4, e3/e3, e3/e4, e4/e4). Ο oμόζυγος e3/e3 είναι ο φυσιολογικός γονότυπος. Οι ισομορφές Ε2 και Ε4 σχετίζονται με υψηλές τιμές τριγλυκεριδίων, αλλά μόνο η Ε2 έχει σχετιστεί με δημιουργία αθηρωματικής πλάκας και υπερλιποπρωτεϊναιμία τύπου ΙΙΙ. Η υπερλιποπρωτεϊναιμία τύπου ΙΙΙ είναι η αιτία στεφανιαίας νόσου. Σε άτομα με πρώιμη εμφάνιση Alzheimer έχει παρατηρηθεί υψηλή συχνότητα του αλληλομόρφου e2.
- 95% ατόμων με υπερλιποπρωτεϊναιμία τύπου ΙΙΙ έχουν γονότυπο e2/e2
- μόνο 1-6% των ατόμων με γονότυπο e2/e2 θα εμφανίσουν συμπτώματα, γιατί υπάρχουν και άλλοι γενετικοί και περιβαλλοντικοί παράγοντες που συνεισφέρουν στην εκδήλωση της ασθένειας
Αλληλόμορφο Τύπος Συχνότητα στον πληθυσμό (%)
Κωδικόνιο στη θέση 112 158
Αμινοξύ στη θέση 112 158
Ισομορφή πρωτείνης e2 Μετάλλαξη 10 TGC TGC Cys Cys E2 e3 Φυσιολογικό 75 TGC CGC Cys Arg E3 e4 Μετάλλαξη 15 CGC CGC Arg Arg E4 Βιολογικό υλικό
Περιφερικό αίμα σε στείρο σωληνάριο γενικής με αντιπηκτικό EDTA.
Εργαστηριακή διερεύνηση
Ενίσχυση του γονιδίου της απολιποπρωτείνης Ε με PCR και ανίχνευση μετάλλαξης στα κωδικόνια 112 και 158 του γονιδίου.
Η ευαισθησία και εξειδίκευση φτάνει το 99,9%.
Αποτελέσματα
Τα αποτελέσματα είναι έτοιμα σε 5 εργάσιμες ημέρες.
-
Τυποποίηση των γονιδίων HLA τάξης Ι και ΙΙ
HLAΤυποποίηση των γονιδίων HLA τάξης Ι και ΙΙ - HLA
Γενικά
Από τα προϊόντα του συμπλέγματος των γονιδίων HLA, το σπουδαιότερο ρόλο παίζουν τα HLA τάξης Ι (Α, Β, CW) και τάξης ΙΙ (DP, DQ, DR). Με την πρόοδο που έχει επιτευχθεί όσον αφορά στη λεπτομερή περιγραφή των αλληλομόρφων HLA, έγινε δυνατή η εκτίμηση της συσχέτισης διαφόρων ασθενειών με συγκεκριμένα αντιγόνα HLA ή απλότυπους HLA.Βιολογικό υλικό
Περιφερικό αίμα σε στείρο σωληνάριο γενικής με αντιπηκτικό EDTA.Εργαστηριακή διερεύνηση
Η μέχρι τώρα εφαρμοσμένη μέθοδος με μονοκλωνικούς αντιορούς δε διαθέτει την ευαισθησία και ειδικότητα της PCR, διότι δεν μπορεί να διακρίνει τους υποτύπους των αλληλομόρφων, με αποτέλεσμα υψηλό ποσοστό ψευδώς αρνητικών αποτελεσμάτων.Αποτελέσματα
Τα αποτελέσματα είναι έτοιμα σε 5 εργάσιμες ημέρες. -
Τυποποίηση HLAB27
HLAB27Τυποποίηση HLAB27 - HLAB27
Εργαστηριακά είναι δυνατός ο έλεγχος της παρουσίας του HLA-B27. Η εφαρμοζόμενη μεθοδολογία βασίζεται στην αλυσιδωτή αντίδραση της πολυμεράσης (PCR), η οποία επιτρέπει τον πολλαπλασιασμό των επιμέρους αλληλομόρφων του HLA-B27. Η προηγούμενα εφαρμοζόμενη ανάλυση με μονοκλωνικούς αντιορούς θεωρείται ξεπερασμένη, γιατί αδυνατεί να διακρίνει τα επιμέρους αλληλόμορφα και θεωρείται χρονοβόρα. Η PCR μπορεί να εφαρμοστεί σε οποιοδήποτε βιολογικό υγρό, ανάλογα με το πρόβλημα, αν και συνήθως η ανίχνευση του HLA-B27 γίνεται στο αίμα, το οποίο συλλέγεται σε στείρο σωληνάριο γενικής με αντιπηκτικό (EDTA) και φυλάσσεται στην ψύξη μέχρι την αποστολή του στο εργαστήριο. Έτσι, με τις νέες τεχνικές έχουν αναγνωριστεί 15 διαφορετικά αλληλόμορφα του HLA-B27 με πιο κοινά τα αλληλόμορφα B27*05 και B27*02.
Η παρουσία ή απουσία του HLA-B27 καθορίζεται γενετικά. Η παραγωγή του ελέγχεται από γονίδια που κληρονομούνται από τους γονείς στα παιδιά. Αν κάποιο μέλος της οικογένειας έχει αυτοάνοση νόσο σχετιζόμενη με το HLA-B27 και ο απόγονος είναι θετικός για το HLA-B27 έχει αυξημένη πιθανότητα να εμφανίσει παρόμοια νόσο.
Βιολογικό υλικό
Περιφερικό αίμα σε στείρο σωληνάριο γενικής με αντιπηκτικό EDTA.Εργαστηριακή διερεύνηση
Έλεγχος της παρουσίας του HLA-B27 με PCR. Η ευαισθησία και εξειδίκευση φτάνει το 99,9%.Αποτελέσματα
Παρουσία ή απουσία κάποιου αλληλομόρφου του HLA-B27. 3-5 εργάσιμες μέρες. -
Ανίχνευση πολυμορφισμού γλυκοπρωτείνης αιμοπεταλίων GPIa
GPIa